В состав управления входит несколько территориальных следственных отделов с дислокацией в освобожденных городах Донбасса и Украины.
В СК РФ отмечают, что в настоящее время в компетентные органы ДНР и ЛНР уже направлены материалы 44 уголовных дел, расследование по которым завершено, а также к передаче подготовлено еще четыре уголовных дела в отношении лиц из числа командующего состава ВСУ.